Меня зовут Елена Убогоева. Я биоинформатик, R-энтузиаст, а в настоящий момент работаю дата-аналитиком в X5Tech, в управлении централизированного мониторинга. Веду телеграм-канал, посвященный R и статистике, преподаю на курсах Blastim: “Статистика, R и анализ данных” и “Анализ данных RNA-seq”.
Этот блог создан с помощью Quarto и будет содержать материалы и статьи, которые были ранее написаны в телеграм-канале.
Образование
Институт цитологии и генетики СО РАН | Новосибирск
Аспирантура по направлению биоинформатики и системной биологии | 2020 - 2022
Новосибирский государственный университет | Новосибирск
Магистратура по направлению цитологии и генетики | 2018 - 2020
Новосибирский государственный университет | Новосибирск
Бакалавриат по направлению цитологии и генетики | 2014 - 2018
Преподавание
Статистика, R и анализ данных от Blastim, учебный ассистент и лектор дополнительных занятий, с 2022 по настоящее время.
Анализ данных RNA-seq от Blastim, лектор, октябрь - ноябрь 2023 года.
Статистика для селекционеров, лектор и ведущий курса, февраль - апрель 2024 года.
Записываю лекции на ютубе, плейлист по ссылке.
Веду индивидуальные занятия по R, статистике и биоинформатике, отчет по итогам 2022-2023 года можно посмотреть здесь.
Предыдущие проекты можно посмотреть здесь.
Список публикаций:
Samalova, M., Melnikava, A., Elsayad, K., Peaucelle, A., Gahurova, E., Gumulec, J., Spyroglou, I., Zemlyanskaya, E. V., Ubogoeva, E. V., Balkova, D., Demko, M., Blavet, N., Alexiou, P., Benes, V., Mouille, G., & Hejatko, J. (2023). Hormone-regulated expansins: Expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth. Plant physiology, 194(1), 209–228. https://doi.org/10.1093/plphys/kiad228
Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Mironova, V. (2022). CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana. Frontiers in plant science, 13, 942710. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.942710
Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J., Mironova, V. (2021). Mechanisms of stress response in the root stem cell niche. Journal of experimental botany, 72(19), 6746–6754. https://doi.org/10.1093/jxb/erab274
Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V., Mironova, V. V. (2018). Deciphering Auxin-Ethylene Crosstalk at a Systems Level. International journal of molecular sciences, 19(12), 4060. https://doi.org/10.3390/ijms19124060